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两月前，燕军进逼皇城，朝廷军队一败涂地，已经没有军队能够抵挡其锐；建文帝朱允文一面组织禁卫军拼死抵抗，一面偷偷地挖掘密道，准备偕老幼出逃，为了封锁消息，建文帝把参与挖掘密道的所有工人全部处死！
禁卫军没能抵抗多久就败下阵来，死的死，逃的逃；燕军已经度过长江，直逼京城；建文帝见大势已去，为了隐藏行踪，竟亲自带人杀死随行妃嫔太监三千，血流成河，并放上一把大火，同时找个形貌相似的穿上龙袍，烧毁容貌，弃尸于东门柳林中；自己则带着亲信十余众悄悄地顺着密道来到两百里开外的金陵码头，准备渡船逃离明境，远赴南海深处某岛。
正当金陵皇城熊熊大火万丈，建文帝却安全地逃离到金陵渡口，然而天有不测风云，南海此时节正是暴风雨肆虐，没有大船愿意出海，这时候，建文帝召集仅有的几位亲信，密谋出逃路线，此前接到锦衣卫的密旨，锦衣卫副使王东从舟山普陀寺秘密得知一上古海图，上面详细绘制出仙芝／ 岛的地理位置和开启仙界之门的秘密，建文和亲信密议妥当各自归仓歇息！子夜时分，大家睡得正酣，突然听得门外侍卫喊声震天：有人逃跑了，快抓回来！只听得噗通一声，门外没了声音。少时，侍卫来报：“刚才门外一人鬼鬼祟祟，被侍卫撞见，跳海逃跑了，月黑风高，不见了踪影。”建文大叫一声不好：“我们得速速出海，事不宜迟，免得被朝廷锦衣卫窥见行踪！”
建文帝，生在政治稳定的皇家，从小聪颖机灵，深得祖父明太祖喜爱，然而由于太祖同姓藩王的分封，在太祖死后成了其稳固皇权的最大威胁，其中实力最强的就是燕王朱棣，燕王自幼追随太祖南征北战，屡立战功，文治武功皆是当今一流，建文最忌惮的就是这位皇叔，然而由于自己年少，疏于管理和谋略，使得削藩措施连连受挫，竟酿成靖难政变，自己也只能隐姓埋名，逃离他乡，然他没有放弃，带着巨大的宝藏和一份寻找仙芝岛的海图，意图出使南海诸国，请求他们发兵援助，力图东山再起，力挽狂澜。
根据海图所记，只要通过琉球，舟山、普陀之后，他们就安全到达爪哇岛了，脱离了朝廷的追捕，进入南海玄境，其境先后经过万蛭岛、千蛇礁、麻六甲、珊瑚国、乱鲨滩、龙洞天、野鄂泽、食人黑潭到达通吃岛；再辗转桃花岛、莲花畔、飞云顶、男子国；万米黑涧、金银岛、血蝠林、死亡之谷、毒蛛林、多宝滩、怒风口、沸腾沙海、蟾蜍幽壑、仙人角；最后才能找到通往仙芝岛的唯一通路。
路途凶险异常，也阻挡不了建文帝寻仙的决心，他命人偷偷地雇佣几条商船，伪装成客商朝着琉球群岛进发，留下许多假线索给朝廷，其中泄露自己行踪也是故意安排的，因为真正的海图只有一份，他命人制作了7份假的航海图，故意让人发放到江湖去，所以也就有郑和七下西洋的千古佳话！
那金陵人到死也不会知道自己只是一个工具而已，因为他早已暴露，建文帝脸上露出一丝得意的笑，连同大船消失在茫茫的大雾芦苇林之中……;