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古懿找不到再多的办法可以一击致命，压制妖皇，他便暂时忍下，开始琢磨四大远古妖像。妖皇如获新生，他急需调整状态并利用好四大远古妖像，自然不会着急进攻。双方好像约好一样，在互相消耗中彼此限制。
天地总算安静下来，光明和黑暗形成前所未有的平衡局面。两个世界在各自发展中互相识别对方的节奏，并且推联演化，最终融合成一体，多个场面同时发生，毁灭与重生在此循环许多次。古懿和妖皇的对决则慢慢变成另外的情况：慢消耗，拼创造。
不断的持久战也导致这个新的世界无法攻不用守，局势变得非常复杂，因为现在谁也无法主动出手，但也简单，因为一旦哪边能打破僵局，那他便有可能占大优势。这一点，古懿和妖皇走向两个不同的方向——在妖皇还想着怎么在这个层次中做强取胜的时候，古懿已经在思考要如何才能使自己超越这一个层次。
因为妖皇更加专注这一个层次的发挥，所以他的优势领先古懿两千年，最后连古懿的世界主宰身份都受到严重挑战。妖皇由此看到战胜古懿的新希望，他有想法要夺权，一旦取代古懿成为世界主宰，那这场战争也结局也将毫无悬念。
无尽的黑暗成为这个世界的主流，排斥并笼罩着大范围的光明。古懿倍受威胁，他本来可以反击，还能击败妖皇，但那样无法做到彻底消灭，而且这样只会让自己的未来路半途而废。所以古懿放弃对抗，尽全力防御，只要保证天地本源和世界主宰身份。
妖皇并未看透古懿的套路，他在占据上风时增大攻势，想要抢夺天地本源，并且将古懿灭杀。妖皇携黑暗碾压光明，化身无数包围古懿，并掌控四大远古妖像发动进攻，越战越猛。
在古懿的策略下，天地本源的外加威力完全发挥不出来，被四大远古妖像撕裂得够严重。妖皇越战越勇，四大远古妖像在他的掌控下也浑然一体，杀得天地本源无力招架，摇摇欲垮。
古懿连忙将身融入天地本源，稳定光明体系。不过妖皇已经疯狂起来，古懿在有所保留的基础上已经难以阻挡妖皇。经过一系列持斗，天地本源被四大远古妖像所镇压，并且强行抹碎成无。就这样，一直被古懿奉为最强法力的天地本源，于此毁灭。
古懿反应不及，被四大远古妖像入侵光明，完全处在下风。天地本源属于稀缺存在，别提自制，就算想引用也是不可能。古懿当时也不能想太多，他在天地本源消失以后被迫必须出手对抗妖皇。
在确认天地本源破损的消息以后，妖皇非常兴奋，他更不肯错过这个千载难逢的绝佳机会，想要一举歼灭古懿和他的世界。无尽妖源在妖皇的掌控下如有魔助，黑暗不断侵袭光明，一声好久不现的震吼响彻天地，彻底压制全部残余的天地本源。
失去天地本源护体，古懿的攻防体系受到严重挑战，他分出升级方向的神识来抗衡妖皇，同时也祭出他最后的王牌——以身作法。古懿由天地本源孕育而生，本身就不是寻常人类，自有超强底蕴，他的本体可谓明界最玄。当天地本源消失瞬间，古懿的本意识开始沸腾，并最终扩展成为本能，自动生成爆发，趋向成本能元素。
见到古懿大爆发，妖皇刚燃起的希望立即熄灭，他马上收回原本愉悦的神情，一脸正色地继续操控无尽妖源去抑制古懿的化法。妖皇不愧是集妖域大成于一身的世界最强者，他的气势完全碾压古懿，使其本能元素锐减，几乎无法持续。
但是古懿继承的元素大具天地本源的本质，同样让妖皇发自内心地忌惮。无尽妖源再强势，也无法大威力地对古懿造成伤害。妖皇有过几次尝试，可是结果都以失败告终，他最终也明白，要想灭掉古懿，从而统治世界，并不能光靠老办法，还要加点猛料。至于猛料究竟是什么，妖皇一时还探索不出来，他只能一边围攻古懿，一边探索思考。
古懿尽管没有遭受灭顶之灾，但代价却不小，他必须时刻保持高强度的防御和极大的本能输出，这非常累。另外，古懿仍然需要钻研未来趋势，因为只有下一个层次，才能让他反败为胜，并且一举彻底灭杀妖皇，断绝妖族的再演化。
双方就这样在互相对抗中拼斗，一直持续数百年。虽然谁也取胜不了，但妖皇明显是占据上风的那一方。
古懿在第三千年终于取得层次上的突破进展——创世不以形而以质，万物皆五行。新道法的出现让古懿得以顺畅将本体转换为本能，在巨大压迫下找到出路。经过五十年的诠释，古懿成功看透妖皇的属性和无尽妖源的本质，这个发现让许久来面无表情的他不禁振奋起来。
无尽妖源非常复杂，妖皇的属性更是不可思议，光看都要花上一年，理解起来非常麻烦。在这一年中，妖皇的优势越来越明显，古懿原本掌控下的大半领域都被侵占。古懿越发感到孤独，不过更有收获，因为他已经找到将妖皇转化为自己世界一部分的可能。这又将是一个漫长的阶段。
五百年过去，妖皇彻底掌控场面。
“哈哈哈！天地使者，我看你还怎么跟我玩！”妖皇肆无忌惮地宣泄着情绪，他从无尽妖源中走出，慢慢走近看起来无可奈何的古懿。所过之处，古版本能自动爆破，妖皇面前一片开阔。他的双眼如同两颗巨大日星，却释放出可怕的黑暗，遥远地将古懿震倒在平面上。
古懿感受到前所未有的重压，他连灵魂都被撕裂，早已不能动弹，若不是主宰本能还在，恐怕再无翻身之时。古懿一边硬抗着妖皇的进攻，一边坚持着解析无尽妖源和妖皇属性。这是他最后的机会，也是唯一的机会。